Indhold
Peptider er fragmenter af korte polymerer sammensat af aminosyrer. Hvert peptid har en bestemt sekvens af aminosyrer betegnet med en kode på tre bogstaver eller kun en; for eksempel forkortes aminosyren alanin som "Ala" eller "A". Belastningen af peptider i opløsningen afhænger af surheden. Det isoelektriske punkt (pI) refererer til surhedsværdien af den opløsning, hvor peptidmolekylet har en nettoladning lig med nul. Peptidets opløselighed er minimal ved det isoelektriske punkt. Brug tilgængelige webservere til at beregne pI-værdien for en peptids aminosyresekvens.
Trin 1
Sekvenser peptidet ved hjælp af enbogstavskoden. For eksempel, hvis et peptid har en aminosyresekvens Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (Alanin - Serin - Glutaminsyre - Leucin - Prolin), ville sekvensen med et bogstav være "ASELP". Hvis det er nødvendigt, henvises til konverteringstabellen på et bogstav til tre bogstaver i afsnittet Ressourcer.
Trin 2
Brug en hvilken som helst browser, såsom Internet Explorer eller Firefox, til at indtaste en server, der beregner det isoelektriske punkt for et peptid (pI); se Ressourcer.
Trin 3
Skriv peptidsekvensen på et bogstav - i vores eksempel "ASELP" - i feltet og klik på "Beregn".
Trin 4
Læs værdien af det isoelektriske punkt (pI) angivet i linjen "Teoretisk pI / Mw" (teoretisk pl). I vores eksempel er pI 4,00. Bemærk, at serveren også beregner peptidets molekylvægt (Mw).