Indhold
Proteiner dannes fra polymer- eller aminosyrekæder. Aminosyresekvensen (sammen med eventuelle ændringer) bestemmer hvilken proteinstruktur den vil vedtage. Proteiner har fire strukturniveauer: primær, sekundær, tertiær og kvaternær. Den primære struktur er kun aminosyresekvensen, medens den sekundære struktur henviser til 3-D-strukturen vedtaget af segmenter af aminosyrekæden.
Alfa helix
En alfa-helix er en meget almindelig type sekundær struktur, hvori kæden af aminosyrer snor sig for at danne en delikat spole. Nitrogen i petidbindingen i hver aminosyre har en hydrogen bundet til den, således at den kan danne en type interaktion kaldet en hydrogenbinding med oxygenatomet i carbonylgruppen af hver binding. Hydrogenbindinger holder propellen sammen og hjælper den med at bevare sin form.
Sidekæder
Alle aminosyresidekæderne i en alfa-helix peger udad, hvilket gør en komplet sløjfe hver 3. 3 aminosyrer. Propellen er snoet med uret, så det er nogle gange beskrevet som "højre". Et protein kan omfatte flere alfa-helixer, og nogle proteiner som keratin (proteinet i hår og negle) har denne type struktur over størstedelen af deres længde.
Beta ark
Et beta-ark er også holdt sammen af hydrogenbindinger, men i dette tilfælde er to regioner af polypeptidet placeret side om side, og hydrogenbindingerne holder dem sammen i en slags plisseret ark papir. De parrede ledninger kan enten rotere i modsatte retninger, i hvilket tilfælde de er antiparallelle, eller de kan være parallelle med begge tråde, der deler samme retning. Det antiparallelle arrangement er mere almindeligt. Aminosyre sidekæderne peger alternativt op og ned, vinkelret på pladens plan.
overvejelser
Polypeptiderne kan indbefatte flere betablader og alfa-helixportionerne som dele af deres samlede 3-D-struktur eller den tertiære struktur. Et enkelt polypeptid kan være et protein alene, eller flere kan binde til dannelse af et protein. Hvis flere polypeptider er involveret, kaldes deres rumlige arrangement en kvaternær struktur. Den sekundære struktur refererer specifikt til egenskaberne af alfa helix og beta ark. Som den tertiære og kvaternære struktur kan den sekundære struktur blive uordnet eller denatureret ved anvendelse af høje temperaturer og / eller signifikante ændringer i pH.